上海德济医院药剂科由临床药学室、门急诊药房、中心药房、麻醉药房和药库六个部门组成，全面负责医院药品供应及药品安全使用，是集药品采购、供应、调配、临床合理用药于一体的综合性科室。

药剂科负责工作涵盖药品调剂、药学监护、药学会诊、血药浓度监测、药物基因检测、药品不良反应监测、麻醉和精神药品管理、药学咨询服务等工作。全科现有药学人员13名，其中副主任药师1名，主管药师4名，主管中药师1名；硕士2人，本科以上学历占药学技术人员总数的84.6%。科室人才梯队中有4名上海市社会医疗机构优秀药师。共计发表科研论文20篇，均为中国药业、中国药房、中国药师、上海医药、儿科药学等核心期刊。

荣获上海市社会医疗机构协会药剂科先进集体、普陀区“药品不良反应监测先进单位”。

门急诊和住院药房目前有西药1200多个品规和中成药300多个品种，大部分为国家基本药物且在医保报销范畴，可满足患者用药需求；门急诊药房现承担每日门诊患者的药学服务工作；中心药房面向全院住院患者提供药品供应和药事管理工作，开展药学服务，设置专岗负责医嘱审核，及时消除患者在诊疗过程中的用药安全隐患。